一套可定制的方法套件来测序和注释牛抗体
Kristel Ramirez Valdez1, Benjamin Nzau1,2, Daniel Dorey-Robinson1
1The Pirbright Institute, Pirbright GU24 0NF, UK.
Vaccines
|June 28, 2023
概括
我们开发了一种灵活的方法来测序牛抗体谱,使抗体反应的高分辨率分析成为可能. 该工具包通过精确表征抗体重光链对来帮助疫苗和治疗开发.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 基因组学就是基因组学.
- 兽医科学 兽医科学 兽医科学
背景情况:
- 了解抗体反应对于疫苗和治疗开发至关重要.
- 高通量测序和免疫信息学工具可以进行详细的抗体库分析.
- 以前的方法缺乏牛的全面高分辨率分析.
研究的目的:
- 详细介绍一套灵活可定制的方法,用于牛中的抗体列表测序.
- 为10x Genomics平台适应现有的方法,以实现本地重光链隔离.
- 为高分辨率牛抗体反应研究提供强大的工具包.
主要方法:
- 流细胞计和单细胞分类.
- 重和轻链放大和抗体测序.
- 适应10x基因组学平台,并使用Ig-Sequence多种类注释工具.
主要成果:
- 成功地从牛B细胞中分离出本地重光链对.
- 从三个工作流处理84,96和8313个B细胞的测序抗体目录.
- 分别获得了24个,31个和4756个抗体重光链对,并讨论了吞吐量,时间表,成本和设备方面的考虑.
结论:
- 开发的方法套件为高分辨率牛抗体反应研究提供了强大的工具包.
- 这些方法灵活,可定制,可适应10x Genomics等平台.
- 这些原则可用于研究其他哺乳动物物种的抗体反应.


