综合性转录基因分析揭示了口腔状细胞癌中的疾病特异性微生物群与宿主相互作用
Vinay Jain1,2, Divyashri Baraniya1, Doaa E El-Hadedy1
1Oral Microbiome Research Laboratory, Department of Oral Health Sciences, Maurice H. Kornberg School of Dentistry, Temple University, Philadelphia, Pennsylvania.
这项研究揭示了在口腔状细胞癌 (OSCC) 组织中独特的,转录活性口腔微生物组. 像Cutibacterium acnes这样的特定微生物与癌症相关的基因表达有关,这表明它们在口腔癌发生过程中发挥了作用.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 口腔状细胞癌 (OSCC) 研究主要使用16SrRNA测序进行微生物组分析.
- OSCC微生物组的功能作用和宿主相互作用在很大程度上仍未被探索.
研究的目的:
- 在OSCC组织中同时表征微生物组和宿主转录组.
- 预测口腔致癌的微生物组与宿主相互作用.
- 确定关键的微生物参与者及其对OSCC的功能性贡献.
主要方法:
- 激光微解剖与瘤/邻近正常组织和健康对照的深度转录酶序列相结合.
- 生物信息分析整合了微生物和宿主转录基因数据.
- 使用口腔癌细胞系进行初步体外验证.
主要成果:
- 在OSCC组织中确定了一个转录活跃的多王国微生物组,与健康对照不同.
- 在OSCC中丰富特定的种群 (例如,Cutibacterium acnes,Malassezia restrita,HHV-6B) 和细菌菌体.
- 与OSCC相关的微生物与上调的宿主繁殖途径相关,包括MYC表达.
- 在相邻的正常组织中,现场癌变的证据.
结论:
- 口腔微生物组在口腔致癌过程中发挥着功能性作用.
- 杆菌可能通过hyaluronate lysase过度表达和MYC通路激活等机制促进OSCC的发展.
- 这项研究为OSCC中微生物组与宿主相互作用提供了新的见解,需要进一步的实验验证.
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