血蛋白生物标志物用于早期预测肺癌
Michael P A Davies1, Takahiro Sato2, Haitham Ashoor2
1Department of Molecular and Clinical Cancer Medicine, Institute of Systems, Molecular & Integrative Biology, The University of Liverpool, William Henry Duncan Building, 6 West Derby Street, Liverpool L7 8TX, UK.
EBioMedicine
|June 28, 2023
概括
血蛋白质组分析可以在诊断前几年预测肺癌风险. 这项研究确定了关键的蛋白质和途径,为肺癌查提供了早期检测和风险分层的潜力.
科学领域:
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 生物标志物发现发现
- 癌症研究 癌症研究
背景情况:
- 血蛋白显示出作为早期肺癌检测的最小侵入性生物标志物具有前途.
- 研究血蛋白质组可以揭示有助于肺癌发展的生物学因素,并有助于预测.
研究的目的:
- 研究血蛋白质组在预测未来肺癌风险方面的潜力.
- 确定与早期肺癌相关的蛋白质生物标志物和途径.
主要方法:
- 利用Olink® Explore-3072平台量化来自利物浦肺部项目的496个血样本中的2941种蛋白质.
- 应用特征选择与引导来识别差异表达蛋白质,并开发了用于肺癌预测的机器学习模型.
- 使用英国生物库数据验证的预测模型,不包括与血液溶解相关的蛋白质.
主要成果:
- 在诊断前1-3年的病例中确定了240种显著不同的蛋白质,在诊断前1-5年的病例中确定了117种额外的蛋白质.
- 机器学习模型的AUC中位数为0.76-0.90 (1-3年) 和0.73-0.83 (1-5年),外部验证的AUC分别为0.75和0.69.
- 在诊断前12年观察到预测能力,独立于年龄,吸烟史,组织学和COPD等因素.
结论:
- 血蛋白质组含有能够识别高风险肺癌个体的生物标记物.
- 根据接近诊断的情况,可以识别出不同的蛋白质和途径,这表明了固有的风险和早期癌症存在的生物标志物.


