在神经退行症和癌症中上下调节的基因中应用编码子使用和上下文分析,以对抗并发性疾病

科学领域:

• 遗传学和分子生物学
• 神经科学是一个神经科学.
• 在瘤学瘤学.

背景情况:

• 神经退行性疾病和癌症通常一起发生,作为并发症.
• 对立的基因表达模式有助于这些条件之间的反向关系.
• 识别共享的分子点对于同时进行治疗干预至关重要.

研究的目的:

• 研究涉及神经退行和癌症的基因中的分子模式,密码子使用和核酸偏差.
• 为了识别特定的基因,这些基因在两个疾病状态中都是上调或下调的.
• 探索这些基因作为联合治疗策略的治疗点的潜力.

主要方法:

• 对四个关键基因的分析:粉样β前体蛋白 (APP),循环D1 (CCND1),循环E2 (CCNE2) (上调) 和蛋白酸酶2酸酶激活剂 (PTPA) (下调).
• 调研代码的使用,代码的使用偏差,第三代码位置的核酸偏差,首选的代码,首选的代码对,罕见的代码和代码上下文.
• 平价分析用于评估核酸偏好和突变力量.

主要成果:

• 核酸T比A更受青,G比C在第三个编码子位置更受青,这表明在上调的基因组中,突变力更强.
• 转录长度显著影响整体核酸组成和代码子偏差.
• 代码子AGG对代码子使用产生了最强的影响;在所有检查的基因中,特定的代码子 (CTA,GTA,CAA,CGT) 代表性不足.

结论:

• 子的使用模式揭示了与神经退行和癌症相关的基因的明显偏差.
• 特定的编码子偏好和不足代表性为这些共同疾病中的基因调节提供了洞察力.
• 有针对性的基因重编码策略,可能使用CRISPR/Cas,可以优化基因表达,同时治疗神经退行和癌症.