综合生物信息学分析和免疫细胞透和性结肠炎相关核心基因的实验验证

科学领域:

• 基因组学和生物信息学
• 免疫学 免疫学 免疫学
• 胃肠病学 胃肠病学

背景情况:

• 性结肠炎 (UC) 是一种复发性自身免疫性疾病,其病因不明.
• 进一步调查UC的病因和分子机制至关重要.

研究的目的:

• 使用生物信息学识别与性结肠炎 (UC) 相关的核心基因.
• 研究已识别的核心基因与UC中的免疫细胞透之间的关系.
• 探索这些核心基因作为UC治疗点的潜力.

主要方法:

• 分析了三个基因表达全方位微阵列数据集.
• 使用机器学习识别差异表达基因 (DEG) 和选核心UC基因.
• 通过接受器操作特征 (ROC) 曲线分析评估核心基因诊断价值.
• 评估免疫细胞透及其与UC和核心基因的相关性,使用CIBERSORT.
• 在体内验证UC结肠组织中的基因和免疫细胞表达.

主要成果:

• 确定了36个差异表达基因 (DEG),其中AQP8,HMGCS2和VNN1被确定为核心UC基因.
• 这些核心基因在ROC分析中表现出高灵敏度和特异性.
• 中性粒细胞,单细胞和巨细胞与UC正相关,并且与核心基因有不同的相关性.
• 在体内研究证实了UC结肠中免疫细胞透的增加,AQP8/HMGCS2降低和VNN1表达的增加.
• 阿扎西奥普林治疗对这些指标产生了积极影响.

结论:

• AQP8,HMGCS2和VNN1被确定为UC的核心基因,与免疫细胞透相关.
• 这些基因代表了性结肠炎的潜在新型治疗标.
• 免疫细胞透在UC的发展和进展中起着重要作用.