同注册的组织学部分与扩散张力成像数据在脑膜瘤瘤200微米分辨率
Jan Brabec1,2,3, Elisabet Englund4, Johan Bengzon5,6
1Medical Radiation Physics, Clinical Sciences Lund, Lund University, Lund, Sweden.
Data in brief
|June 29, 2023
概括
这项研究将脑膜瘤瘤微观结构与使用ex-vivo扩散MRI的扩散张力成像 (DTI) 参数联系起来. 研究人员提供联合注册的数据和处理工具,以了解脑瘤中DTI变异.
科学领域:
- 神经成像是一种神经成像.
- 在瘤学瘤学.
- 生物物理学的生物物理.
背景情况:
- 扩散MRI (dMRI) 参数,如平均扩散度 (MD) 和微分异型 (FA),用于研究脑瘤,但它们在脑膜瘤中的解释是复杂的.
- 关于MD和FA与细胞密度和异质性相关的现有假设受到瘤内部变异和其他微观结构因素的挑战.
研究的目的:
- 调查脑膜瘤微结构特征与扩散张力成像 (DTI) 参数之间的关系.
- 提供数据集和处理管道,用于将ex-vivodMRI数据与脑膜瘤组织学相关联.
主要方法:
- 在不同类型和等级的16个脑膜瘤样本上以200微米同otropic分辨率进行了ex-vivo dMRI.
- 联合注册的扩散权重信号 (DWI) 地图和DTI参数 (MD,FA,FAIP,AD,RD) 到血氧素和氨酸 (H&E) 和Elastica van Gieson (EVG) 染色的组织学截面.
- 利用基于非线性地标的方法进行准确的数据共注册,并提供开源处理工具.
主要成果:
- 生成的DWI信号和DTI参数图与组织学部分共同注册,用于详细的微观结构分析.
- 建立了一个处理原始dMRI数据的管道,并与组织学图像进行精确的联合注册.
- 在AIDA数据中心注册表上公开提供原始,处理和共同注册的数据.
结论:
- 提供的数据集和方法有助于研究脑膜瘤中DTI参数的微结构基础.
- 这项工作有助于了解不同类型和等级的脑膜瘤瘤中DTI指标的变化.
- 开放访问的数据和工具支持未来的调查,将脑膜瘤生物学与神经成像发现联系起来.
