精制血清miR-371a-3p测试以检测可活性的生殖细胞瘤
John T Lafin1, Cinzia G Scarpini2, Armon Amini1
1Department of Urology, University of Texas Southwestern Medical Center, Dallas, USA.
Scientific reports
|June 29, 2023
概括
血清miR-371a-3p显示有望检测隐藏的生殖细胞瘤 (GCT). 通过使用原始Cq值和不确定的范围来改进试验,精度提高到0.92,用于最小残留疾病检测.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子诊断学 分子诊断
- 生物标志物发现发现
背景情况:
- 循环中的miR-371a-3p是生殖细胞瘤 (GCT) 的有希望的生物标志物.
- 它在检测最小残留疾病和隐性GCT方面的实用性需要进一步改进.
- 测试方法的标准化对于可靠的临床应用至关重要.
研究的目的:
- 改进血清 miR-371a-3p 试验以检测隐性 GCT 在最小残留疾病环境中.
- 为了比较原始 (Cq) 与正常化 (∆Cq,RQ) 值的性能.
- 为了验证测试的实验室间一致性.
主要方法:
- 血清miR-371a-3p检测原始Cq和正常化值的比较.
- 实验室间一致性的验证使用aliquot swapping.
- 在32名疑似隐性逆关节疾病患者队列中的绩效评估.
- 使用德隆方法进行接收机-运营商特征 (ROC) 曲线分析.
- 引入一个不确定的范围 (Cq 28-35),重复测试.
主要成果:
- 使用原始Cq或正常化值的测试性能可比.
- 观察到miR-371a-3p的高间实验室一致性,但参考基因显示不一致.
- 实施不确定的范围和重复测试提高了从0.84到0.92.9的测试精度.
- 修订后的测定方法在检测隐藏的GCT方面表现优异.
结论:
- 血清miR-371a-3p测定可以有效地利用使用原始Cq值的基于值的方法.
- 建议将内源和外源的spike-in微RNA纳入质量控制.
- 重复运行带有不确定的结果的样本可以提高隐性GCT检测的测定精度.
