评估高吞吐量含有硫醇的光探针用于选反应性的实用性:与Tox21图书馆的案例研究
Grace Patlewicz1, Katie Paul-Friedman1, Keith Houck1
1Center for Computational Toxicology & Exposure (CCTE), U.S. Environmental Protection Agency, Research Triangle Park, Durham, NC, 27709, USA.
Computational toxicology (Amsterdam, Netherlands)
|June 30, 2023
概括
这项研究开发了一种基于光的测定方法,以识别醇反应性化学物质,这对于理解化学反应性和优先考虑高通量查 (HTS) 的安全测试至关重要. 该测试有助于通过识别非特异性化学反应性来预测潜在的危险.
科学领域:
- 毒理学 毒理学 毒理学
- 化学生物学 化学生物学
- 计算化学的计算化学
背景情况:
- 高通量选 (HTS) 试验对于评估化学生物活性至关重要,但缺乏识别非特异性反应性化学品的方法.
- 识别反应性化学物质对于优先测试,标记杂交化合物和理解非受体介导的危害,如皮肤敏感性至关重要.
研究的目的:
- 开发和验证一种基于光的HTS试验,用于识别醇反应化合物.
- 选一个大型化学图书馆的醇反应性,并建立基于化学结构的预测模型.
主要方法:
- 基于光的HTS测定被用来选7,872种来自Tox21 10K化学库的独特化学物质.
- 用电友信息编码的结构警报用于比较,并使用化学指纹开发了随机森林分类模型.
- 模型使用10倍分层交叉验证 (CV) 进行了评估.
主要成果:
- 该试验成功地在选图书馆内识别了醇反应化合物.
- 随机森林模型在预测试验结果时实现了0.648的平均CV平衡精度.
- 开发的模型证明了仅仅基于化学结构来预测电友反应的潜力.
结论:
- 基于光的HTS测定是一种有前途的工具,用于识别醇反应化学物质.
- 基于化学结构的预测模型在选未经测试的化学物质以检测电友反应性方面具有实用性.
- 这种方法可以帮助确定化学品的优先级,并了解非特定的化学危险.
