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Updated: Jul 25, 2025
07:50
Genome-Wide Analysis of DNA Methylation in Gastrointestinal Cancer
Published on: September 18, 2020
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高DNA甲基化年龄减速在子宫内膜癌中定义了一个具有免疫排除环境的侵略性表型
Jing Hao1,2, Tiantian Liu3, Yuchen Xiu3
1Department of Clinical Laboratory, Qilu Hospital of Shandong University, Jinan, China.
Frontiers in immunology
|June 30, 2023
概括
子宫内膜癌通常表现出加速衰老,其中一个子集表现出高DNA甲基化衰老减速 (DNAmad+). 这些瘤已发病,存活率较低,对免疫疗法反应较低.
科学领域:
- 表观遗传学和癌症生物学
- 基因组不稳定性和衰老
- 瘤微环境和免疫疗法
背景情况:
- 全球DNA低甲基化作为线粒钟,抑制癌症的进展.
- DNA甲基化 (DNAm) 年龄钟预测时间年龄,但在瘤中漂移,表明在致癌过程中老化调节受损.
- 人们对DNAm年龄变化及其对子宫内膜癌 (EC) 的影响知之甚少.
研究的目的:
- 用Horvath和Phenoage时钟分析子宫内膜癌 (EC) 中的DNAm年龄变化.
- 为了研究DNAm年龄减速在EC的生物学和临床影响.
- 探索DNAm年龄对EC风险分层和免疫治疗反应的潜在影响.
主要方法:
- 对ECs的TCGA和GSE67116队列的分析.
- 在EC瘤样本上应用Horvath和Phenoage DNAm年龄钟.
- DNAm年龄减速 (DNAmad) 与临床,遗传和分子特征的相关性,包括拷贝数变化 (CNA),瘤突变负担,途径丰富,基因表达和免疫微环境标记.
主要成果:
- 近90%的ECs表现出DNAm年龄减缓 (DNAmad).
- 一个瘤子集 (hDNAmad+) 通过两个时钟都显示出高DNAmad,并与晚期疾病,更短的存活率,更高的CNAs,更低的瘤突变负担以及细胞周期和DNA不匹配修复途径的丰富有关.
- hmadDNA+瘤表现出免疫排除,较高的VTCN1和较低的PD-L1/CTLA4表达,表明对免疫检查点抑制剂 (ICI) 的反应不佳.
- 在hDNAmad+瘤中观察到增加的PIK3CA变化,SCGB2A1的下调,衰老调节器 (TP53,RB1,CDKN2A) 的失活,增强的端粒维护和更高的DNMT3A/3B表达.
结论:
- DNAm年龄减缓在EC中普遍存在,并与侵袭性瘤特征和衰老瘤抑制功能受损有关.
- 在EC中,高DNAm年龄减速 (hDNAmad+) 表示与基因组不稳定性和免疫逃避相关的独特分子亚型.
- 研究结果表明,DNAm年龄变化为EC风险分层和个性化免疫治疗策略提供了宝贵的见解.
