综合生物信息学分析揭示了OSBPL3在肝细胞癌中的功能和预后价值
Yuanshuai Su1, Chen Xue1, Xinyu Gu1
1State Key Laboratory for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, National Clinical Research Center for Infectious Diseases, National Medical Center for Infectious Diseases, Collaborative Innovation Center for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, The First Affiliated Hospital, Zhejiang University School of Medicine, 79 Qingchun Rd., Hangzhou, 310003, China.
Heliyon
|June 30, 2023
概括
氧化结合蛋白类3 (OSBPL3) 在肝肝细胞癌 (LIHC) 中被上调,与晚期疾病和不良预后相关. OSBPL3可以作为一个有价值的生物标志物和LIHC的治疗点.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 癌症研究 癌症研究
背景情况:
- 肝肝细胞癌 (LIHC) 是一种高度攻击性的恶性瘤,是癌症死亡的主要原因.
- 氧化结合蛋白类型3 (OSBPL3) 已与各种人类癌症有关,但其在LIHC中的具体作用尚不清楚.
研究的目的:
- 研究OSBPL3在LIHC中的功能作用和临床意义.
- 探索OSBPL3作为LIHC的潜在生物标志物和治疗标.
主要方法:
- 使用TCGA数据库通过UALCAN用于OSBPL3表达和临床特征分析LIHC.
- 采用TIMER数据库来评估OSBPL3对瘤免疫透的影响.
- 使用LinkedOmics和STRING数据库构建了一个蛋白质与蛋白质相互作用 (PPI) 网络,用于OSBPL3相关的差异表达基因 (DEG).
主要成果:
- 在LIHC组织中,OSBPL3表达显著上调,特别是在更高等级和晚期瘤中.
- 过度表达的OSBPL3与LIHC患者较差的临床结果和预后相关.
- 从PPI网络中确定的六个枢纽基因在LIHC中也升高,并与预后不佳有关. 途径分析显示了蛋白质结合,线粒细胞动力学和NF-kappaB信号的丰富.
结论:
- 在肝癌发生过程中,OSBPL3起着至关重要的作用.
- OSBPL3显示出作为诊断生物标志物和LIHC的治疗点的潜力.
