根据生物信息学和实验验证的证实,PILRA与心房的免疫细胞透有关
Weihua Shi1, Xiaoli Li1, Yongxing Su1
1Department of Cardiology, First Affiliated Hospital, Guangxi Medical University, Nanning, China.
Frontiers in cardiovascular medicine
|July 3, 2023
概括
炎症是心房动 (AF) 的关键. 这项研究确定了PILRA作为与AF中的免疫细胞透相关的枢纽基因,这表明PILRA是AF的潜在治疗标.
科学领域:
- 心血管研究研究心血管研究
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 遗传学 遗传学是一种遗传学.
背景情况:
- 炎症在心房动 (AF) 的病理生理学中起着至关重要的作用.
- 免疫细胞透越来越被认为是AF发展和进展的重要因素.
研究的目的:
- 研究免疫细胞透在AF中的作用.
- 确定调节AF中免疫细胞透的关键基因 (枢纽基因).
主要方法:
- 来自GEO数据库的AF数据集的差异基因表达分析.
- 基因本体学 (GO),基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 和基因组丰富分析 (GSEA) 用于丰富分析.
- 最小绝对收缩选择操作员 (LASSO) 回归和权重基因联合表达网络分析 (WGCNA) 以确定枢纽基因.
- 定量聚合酶连锁反应 (qPCR) 用于在AF大鼠模型中进行验证.
- 单样GSEA (ssGSEA) 用于分析免疫细胞透及其与枢纽基因的相关性.
主要成果:
- 鉴定了298个差异表达基因 (DEGs),与炎症,免疫和细胞因子相互作用有关.
- 通过LASSO和WGCNA确定了包括PILRA在内的四个枢纽基因.
- 与对照组相比,AF老鼠的PILRA表达显著增加.
- ssGSEA揭示了AF与中性粒细胞,巨细胞,单细胞,巨细胞,不成熟的B细胞,骨髓衍生抑制细胞 (MDSC),树突细胞和T细胞的透之间的密切关系.
- 皮尔拉与这些免疫细胞类型中的几种细胞有正相关性.
结论:
- 皮尔拉与AF中各种免疫细胞透密切相关.
- 皮尔拉代表了AF干预的潜在新型治疗标.
