针对小鼠脚板免疫细胞隔离的优化协议,用于单细胞RNA测序和流细胞计
Muddassar Hameed1, Pallavi Rai1, Melissa Makris2
1Department of Biomedical Sciences and Pathobiology, VA-MD Regional College of Veterinary Medicine, Virginia Tech, Blacksburg, VA 24060, USA; Center for Zoonotic and Arthropod-borne Pathogens, Virginia Polytechnic Institute and State University, Blacksburg, VA 24060, USA.
STAR protocols
|July 4, 2023
概括
这项研究详细介绍了一种方法,用于隔离具有高可行性单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 的小鼠脚白细胞. 该协议允许创建一个全面的单细胞分子地图.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 基因组学就是基因组学.
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- 高细胞活力对于可靠的单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 结果至关重要.
- 将白细胞从具有挑战性的组织中分离出来,例如老鼠的脚,需要优化协议.
研究的目的:
- 介绍一个详细的协议,以隔离小鼠脚白细胞.
- 为了确保下游scRNA-seq应用的隔离过程中高细胞活力.
主要方法:
- 脚组织收集和酶分离.
- 白血球的隔离,净化,固定和保存.
- 组合条形码,库编制,scRNA-seq和数据分析.
主要成果:
- 成功隔离了具有高生存能力的小鼠脚白细胞.
- 证明该协议适合生成单细胞分子地图.
结论:
- 提出的协议有效地从小鼠脚中隔离了可行的白细胞.
- 这种方法有助于进行全面的单细胞分析和构建分子图谱.
