单细胞B细胞测序生成原生配对的scFab酵母表面显示库
Nathaniel Pascual1,2, Theodore Belecciu1,2, Sam Schmidt1,2
1Department of Chemical Engineering and Materials Science, Michigan State University, East Lansing, MI, USA.
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
|July 5, 2023
概括
这项研究提出了一种简化方法,用于设计使用单细胞RNA测序来识别B细胞受体序列的罗诺斯基单克隆抗体. 这种方法可以实现抗体碎片的高通量表征和优化,以改善治疗应用.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 生物技术是生物技术.
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 提供了强大的免疫细胞分析能力.
- 治疗性单克隆抗体 (mAbs) 需要精确的设计来进行向治疗.
- 目前用于抗体发现的方法可能是复杂和耗时的.
研究的目的:
- 介绍一种简化的工作流程,用于设计诺斯基单克隆抗体.
- 为了利用scRNA-seq识别本地配对的B细胞受体 (BCR) 序列.
- 为了促进抗体碎片的高通量表征和优化.
主要方法:
- 利用scRNA-seq来确定免疫小鼠的配对BCR序列.
- 开发了一种工作流程,用于在酵母表面表达单链抗体碎片 (scFabs).
- 集成的酵母表面显示器用于高通量选和定向进化.
主要成果:
- 建立了针对抗体片段表达和特征的简化方法.
- 启用了用于mAb设计的功能BCR序列的快速识别.
- 展示了一个平台,可以进行 in silico 优化,以获得亲和力和稳定性.
结论:
- 描述的方法简化了theranostic mAbs.的设计和优化.
- scRNA-seq与酵母显示相结合,加速了抗体的发现和发展.
- 这个工作流程支持创建改进的抗体疗法,并增强可开发性标准.
