在605名患有非综合征性心脏干缺陷的中国儿童的致病变体分析,基于针对性测序
JiaJun Ye1, Yiwei Niu1, Yongxuan Peng1
1Department of Pediatric Cardiology, Xinhua Hospital, School of Medicine, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai 200092, China.
Genomics
|July 5, 2023
概括
在中国患者中发现了与心脏干缺陷 (CTD) 相关的基因的遗传变异. 针对性测序揭示了超过11%的非综合征性CTD病例中的有害变异,有助于基因诊断.
科学领域:
- 遗传学和基因组学 在
- 心血管疾病 心血管疾病
- 发展生物学 发展生物学
背景情况:
- 有害的遗传变异是已知的心脏干缺陷 (CTD) 的原因之一.
- 识别与CTD相关的基因对于了解疾病病因至关重要.
- 非综合征性CTD占先天性心脏病的很大一部分.
研究的目的:
- 调查CTD相关基因中基因变异的特征,在一个非综合征性CTD患者的中国队列中.
- 确定有助于非综合征性CTDs发展的特定基因和变异.
- 评估向性外因子测序对CTD遗传诊断的有用性.
主要方法:
- 根据文献审查 (NCBI,HGMD,OMIM,HPO) 选择了39个CTD相关基因.
- 招募605名患有非综合征性CTD的患者和300名汉族健康对照.
- 使用预测程序 (CADD,SIFT,PolyPhen-2,MutationTaster) 进行高通量向测序和严格的变体过,以识别破坏性变体 (Dvars).
主要成果:
- 在66.7%的目标CTD相关基因中检测到有害变异.
- 超过11% (67/605) 的非综合征性CTD患者在研究基因中携带一个或多个Dvars.
- 在FOXH1,TBX2,NFATC1,FOXC2和FOXC1基因中发现了常见的Dvars.
结论:
- 向性外因子测序是一种有效且具有成本效益的方法,用于CTD的遗传诊断.
- 这些发现增强了对研究人口中非综合征性CTDs遗传基础的理解.
- 这项研究为临床诊断和CTD遗传咨询提供了有价值的遗传信息.
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