单细胞转录组分析揭示了细胞异质性,并突出了出生时小鼠肺中的Fstl1-调节的膜肌纤维细胞
Si Zhang1, Xiuxue Mo2, Yueyue Jin1
1College of Life Sciences, Tianjin Key Laboratory of Protein Sciences, Nankai University, Tianjin 300071, China.
Genomics
|July 5, 2023
概括
佛利斯塔丁类蛋白1 (FSTL1) 蛋白对肺部发育至关重要. 它的缺失会损害肌纤维细胞功能和肺囊形成,影响细胞外矩阵组织和血管发育.
科学领域:
- 发展生物学 发展生物学
- 细胞生物学 细胞生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 一种母细胞蛋白质,类似于folistatin的1 (FSTL1),在肺部发育和囊形成中起作用.
- 了解FSTL1功能背后的细胞和分子机制对于解决肺部发育异常至关重要.
研究的目的:
- 通过单细胞RNA测序来研究FSTL1在肺发育中的作用.
- 在肺发育过程中识别受FSTL1缺乏影响的特定细胞类型和分子通路.
主要方法:
- 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 在胚胎 18.5.5 日从野生型和 Fstl1 淘汰赛小鼠肺部的 22,774 个单细胞上进行.
- 生物信息分析被用来构建一个转录基因地图,识别细胞亚型,并分析基因表达特征.
主要成果:
- 在正在发育的肺部中发现了27种不同的细胞亚型.
- Fstl1 缺乏导致不同细胞亚型的种群大小和基因表达发生变化.
- 由Pdgfra和Tgfbi标记的产后肌纤维细胞 (MyoFBs) 在Fstl1淘汰肺部减少.
- 删除FSTL1降低了MyoFB在细胞外基质组织和肌肉/血管发育中的功能,部分通过TGF-β1 / BMP4信号通路.
结论:
- FSTL1对于维持发育中的肺部,特别是肌纤维细胞的细胞组成和功能至关重要.
- 由于FSTL1缺乏,导致异常的囊形成和脱,通过改变的信号通路进行介导.
- 这项研究提供了肺部发育的单细胞分辨率图和FSTL1损失的影响.
