PPSW-SHAP:使用基于树的SHAP图像分解和恢复进行可解释的细胞分类,用于高通量明亮场成像
Polat Goktas1,2, Ricardo Simon Carbajo1,2
1UCD School of Computer Science, University College Dublin, Belfield, D04 V1W8 Dublin, Ireland.
Cells
|July 6, 2023
概括
这项研究引入了一种新的AI方法,通过减少图像噪声和提高模型解释性来改善细胞疗法制造. 该方法通过使用先进的图像处理和机器学习技术,提高了细胞表征的精度.
科学领域:
- 生物技术是生物技术.
- 医疗成像医学成像
- 人工智能的人工智能
背景情况:
- 高通量显微镜对于细胞治疗 (CT) 制造中的细胞分析至关重要.
- 显微镜中的图像噪声和文物可以导致不准确的AI模型发现.
- 当前的人工智能模型在没有广泛的训练数据的情况下与噪音作斗争.
研究的目的:
- 开发一种可靠的方法来降低用于CT制造的显微镜图像中的噪声.
- 创建一个可解释的机器学习 (ML) 平台,以提高最终用户的理解.
- 为了提高CT制造中细胞表征的精度.
主要方法:
- 实现了一个周期性加光滑波段 (PPSW) 变换,用于图像噪声分解和恢复.
- 开发了一个可解释的ML平台,使用基于树的Shapley添加式扩展 (SHAP).
- 应用监督聚类与平均SHAP值在分解的人类介质干细胞 (MSC) 的明亮场图像上.
主要成果:
- 该PPSW有效地将减少的系统噪声转化为显微镜图像.
- 基于SHAP的ML平台为AI模型提供了端到端的解释性.
- 在各种培养条件下,MSCs在细胞表征中获得了更高的精度.
结论:
- 结合降噪和可解释的ML方法,提高了CT制造中的AI性能.
- 这种框架通过在预处理过程中处理文物来降低AI的学习负载.
- 该研究表明,对CT生产的可靠和可理解的细胞分析取得了重大进展.


