来自印度喀拉拉邦的猪肉循环病毒2的分子表征和原始遗传学分析
Shashank Somashekara1, Chintu Ravishankar1, Rajasekhar Ravindran1
1Department of Veterinary Microbiology, College of Veterinary and Animal Sciences, Kerala Veterinary and Animal Sciences University, Lakkidi P.O, Pookode, Kerala 673576 India.
Virusdisease
|July 6, 2023
概括
在喀拉拉猪中检测到猪肉病毒2型 (PCV2) 基因型2d,2h和2b,其中基因型2d占主导地位. 这项研究强调了新PCV2基因型在该地区的流行率增加和最近的引入.
科学领域:
- 兽医病毒学 兽医病毒学
- 分子流行病学分子流行病学
- 动物卫生 动物健康
背景情况:
- 猪肉环状病毒2型 (PCV2) 作为猪肉环状病毒相关疾病 (PCVADs) 的病原体,在全球范围内造成重大经济损失.
- 在猪中,PCV2感染表现出各种临床症状,包括呼吸困难和丧.
研究的目的:
- 调查印度喀拉拉邦猪中PCV2的流行率和遗传多样性.
- 了解该地区PCV2基因型的分子流行病学和进化动态.
主要方法:
- 从62头可疑感染PCV2的猪身上采集了死后组织样本.
- 聚合酶链反应 (PCR) 用于PCV2检测.
- 对完整的ORF2和整个基因组序列进行了遗传学分析.
主要成果:
- 在36个样本中检测到PCV2 (58.06%).
- 确定了2d,2h和2b的基因型,其中2d基因型占主导地位.
- 基因型2h和2b似乎是最近引入到北喀拉拉的 (2016年后).
- 克拉拉的序列显示出与来自印度其他州的分离物有密切的遗传学关系.
- 观察到一个独特的K243N突变和ORF2中氨基酸位置169的高变异性.
结论:
- 在喀拉拉邦,多个PCV2基因型在猪中循环,其流行率高于之前报告的.
- 这些发现强调了PCV2进化和在印度传播的动态性质.


