热测序分析用于快速准确地检测伊朗Helicobacter pylori分离物中与克拉里素耐药性相关的突变
Helia Alavifard1, Ali Nabavi-Rad1, Kaveh Baghaei2
1Foodborne and Waterborne Diseases Research Center, Research Institute for Gastroenterology and Liver Diseases, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran.
BMC research notes
|July 6, 2023
概括
激光测序提供了一种快速有效的方法,用于检测Helicobacter pylori (H. pylori) 感染中的克拉里素耐药性突变. 这种方法有助于指导治疗以获得更好的根除结果.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 遗传学 是一个遗传学.
- 临床诊断 临床诊断 临床诊断
背景情况:
- 杆菌 (H. pylori) 的抗生素耐药性使感染治疗复杂化.
- 克拉里思罗米辛耐药性,通常是由于23S rRNA点突变,导致根除失败.
研究的目的:
- 开发和评估热测序作为一种快速和精确的方法,用于识别H.pylori.中与克拉里胺耐药性相关的点突变.
主要方法:
- 分析了82次胃活检中的H. pylori分离物.
- 克拉里思罗米的最小抑制度 (MIC) 用稀释剂确定.
- 点突变最初是通过桑格测序检测到的,11个分离物进一步通过热测序进行分析.
主要成果:
- 观察到克拉里胺抗药的患病率为43.9% (36/82).
- 检测到的特定突变包括A2143G (8.3%),A2142G (6.2%),C2195T (4.1%),T2182C (4.1%),以及C2288T (2%).
- 热测序结果与桑格测序相似,尽管C2195T只被桑格检测到.
结论:
- 热测序是临床实验室评估H. pylori易感性的实用和快速平台.
- 这种方法可以在突变检测后促进向的H. pylori根除策略.
