合成尿样的NMR代谢物量化:处理工作流程的实验室间比较
Cécile Canlet1, Catherine Deborde2, Edern Cahoreau3
1Toxalim (Research Centre in Food Toxicology), Toulouse University, INRAE UMR 1331, ENVT, INP-Purpan, UPS, MetaToul-AXIOM Platform, National Infrastructure of Metabolomics and Fluxomics: MetaboHUB, INRAE, 31027, Toulouse, France.
概括
外部校准和光谱解卷工具改善了基于NMR的代谢形分析中的代谢物量化. 实验室间测试是选择最佳量化策略和验证这些先进工具以获得准确结果的关键.
科学领域:
- 分析化学 分析化学
- 生物化学 生物化学
- 代谢学 代谢学 代谢学
背景情况:
- 在复杂的生物样本中精确量化单个代谢物的量化对于有针对性的代谢学分析至关重要.
- 核磁共振 (NMR) 光谱是对代谢物量化的强大工具.
研究的目的:
- 评估NMR软件,峰值区域确定方法 (整合与解卷) 和操作员可变性对量化准确性 (真实性) 和可重现性 (精度) 的影响.
- 为了比较基于NMR的新陈代谢概况的不同量化策略.
主要方法:
- 通过使用含有32种化合物的合成尿样进行了一项实验室间的研究.
- 通过使用两个脉冲序列 (zgpr和NOESYpr) 与水抑制来获得NMR光谱.
- 不同地点的运营商使用内部引用 (TSP) 或外部校准量化了代谢物,使用各种NMR软件工具 (内部,开放式访问,商业).
主要成果:
- 与TSP内部引用相比,外部校准为代谢物量化提供了更高的真实性 (准确性).
- 大约90%的代谢物被量化为<5%的真实性,使用峰值集成和外部校准.
- 光谱解卷工具改善了可量化的代谢物数量及其对某些化合物的真实性.
- 通过NMRProcFlow集成模块,可以量化额外的代谢产物.
结论:
- 在这种情况下,外部校准优于TSP内部引用用于代谢物量化.
- 实验室间测试对于合理化NMR代谢学中量化工具的选择是有价值的.
- 光谱解卷工具为提高代谢物量化的准确性和范围提供了显著的优势.
