定量聚合酶连锁反应试验的设计和验证,用于识别和量化与牙周炎相关的不可培养细菌
Yormaris Castillo1, Nathaly Andrea Delgadillo1, Yineth Neuta1
1Universidad El Bosque, Vicerrectoría de investigaciones, Facultad de Odontología, Unidad de Investigación Básica Oral-UIBO, Bogotá, Colombia.
Archives of oral biology
|July 7, 2023
概括
开发了一种新的定量聚合酶链反应 (qPCR) 测试,以检测和量化与牙周炎相关的无法培养的细菌. 这种经过验证的qPCR方法在识别与疾病相关的关键细菌物种方面具有很高的准确性.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 分子生物学分子生物学
- 牙周病学 牙周病学
背景情况:
- 牙周炎是一种复杂的口腔疾病,通常与无法培养的细菌有关.
- 准确识别和量化这些细菌对于了解疾病的发病因子和开发向疗法至关重要.
研究的目的:
- 标准化一种定量聚合酶连锁反应 (qPCR) 试验,用于检测和量化涉及牙周炎的特定不可培养细菌.
- 为了验证开发的qPCR测定与下一代测序 (NGS) 进行临床样本分析.
主要方法:
- 使用16S rRNA基因点对Eubacterium saphenum,Eubacterium brachy,Desulfobulbus oralis和Filifactor alocis进行qPCR检测的标准化.
- 验证了从牙周炎和健康/牙周炎患者的55个下生物膜样本上的qPCR测试,将结果与NGS数据进行比较.
- 包括科恩卡帕指数,灵敏度,特异性和ROC曲线分析在内的统计分析.
主要成果:
- 在qPCR测试显示高效率 (90-100%) 和优秀的线性 (R2:0.997-0.999).
- 针对目标细菌的qPCR和NGS之间观察到中等到相当一致 (卡帕:0.37-0.56).
- qPCR对E. brachy,E. saphenum和F. alocis表现出高灵敏度 (82.2-100%) 和特异性 (100%),与NGS相比,对E. saphenum的灵敏度更高.
结论:
- 新开发和验证的qPCR测试有效检测和量化与牙周炎相关的无法培养的细菌 (D. oralis,E. brachy,E. saphenum,F. alocis).
- 这种qPCR测定为临床诊断和牙周病理学研究提供了可靠的工具.
