基因型和敏感性测试在埃及亚历山大发现了大型耐醇的Candida tropicalis类
Bram Spruijtenburg1, Eelco F J Meijer1, Meng Xiao2
1Department of Medical Microbiology and Infectious Diseases, Canisius-Wilhelmina Hospital, 6532 SZ Nijmegen, The Netherlands; Center of Expertise in Mycology Radboud University Medical Center/Canisius-Wilhelmina Hospital, 6532 SZ Nijmegen, The Netherlands.
Journal of global antimicrobial resistance
|July 7, 2023
概括
在埃及的一项研究发现了大型耐醇的Candida tropicalis类,这给重症监护室患者带来了治疗挑战. 观察到有限的医院传染,但耐药酵母菌群仍然是一个重大问题.
科学领域:
- 医学真菌学 医学真菌学
- 传染性疾病 传染性疾病
- 遗传学 是一个遗传学.
背景情况:
- 热带是一种新兴的机会性病原体,特别是在重症监护病房 (ICU).
- 在C. tropicalis.中发现了高遗传多样性和日益增长的抗真菌耐药性,特别是对醇的耐药性.
- 包括埃及在内的低收入和中等收入国家的基因型数据有限.
研究的目的:
- 为了研究来自埃及亚历山大市ICU患者的Candida tropicalis分离物的抗真菌易感性和遗传多样性.
- 为了确定醇耐药性的程度,并确定C. tropicalis分离物之间的遗传关系.
- 评估埃及ICU中C.热带菌的医院传染模式.
主要方法:
- 对来自埃及ICU患者的64个C. tropicalis分离物进行了抗真菌敏感性测试.
- 基因定型是使用短串重复 (STR) 分析进行的.
- 整个基因组测序 (WGS) 单核酸多态性 (SNP) 分析用于高分辨率的基因分析.
主要成果:
- 在38% (24/64) 的隔离物中检测到可纳耐药性,其中23个隔离物含有ERG11 G464S替代物.
- 在STR和WGS SNP分析中,发现了一种独特的,基因相关的C. tropicalis耐醇分离物.
- 尽管基因关系在关节内,WGS揭示了至少429个SNP差异,表明了独立的引入.
结论:
- 在埃及亚历山大存在一种重要的耐醇C. tropicalis类,这使得ICU患者的治疗复杂化.
- 遗传分析表明,C. tropicalis的临床传染有限.
- 需要进一步的研究来了解埃及C. tropicalis中醇耐药性的出现和传播.
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