全球基线为qPCR确定的抗微生物耐药性基因在环境中的流行率
Anna Abramova1, Thomas U Berendonk2, Johan Bengtsson-Palme1
1Department of Infectious Diseases, Institute of Biomedicine, The Sahlgrenska Academy, University of Gothenburg, Guldhedsgatan 10A, SE-413 46 Gothenburg, Sweden; Centre for Antibiotic Resistance research (CARe) in Gothenburg, Sweden; Division of Systems and Synthetic Biology, Department of Life Sciences, SciLifeLab, Chalmers University of Technology, SE-412 96 Gothenburg, Sweden.
对抗微生物药物耐药性 (AMR) 的环境监测至关重要. 这项研究为各种环境中的抗菌素耐药性基因 (ARG) 建立了基线,为未来的抗菌素耐药性监测和风险评估提供了必要的数据.
科学领域:
- 环境科学环境科学
- 微生物学 微生物学
- 公共卫生 公共卫生
背景情况:
- 抗菌素耐药性 (AMR) 是一个日益增长的全球威胁.
- 由于参考数据有限,对抗药物耐药性的环境监测尚未得到充分发展.
- 确定基线AMR水平对于检测环境抵抗至关重要.
研究的目的:
- 建立在不同的环境环境中对抗微生物耐药性基因 (ARG) 的基线.
- 从全球环境样本收集和分析现有的关于ARG的qPCR数据.
- 为AMR监测和风险评估框架提供参考数据.
主要方法:
- 进行了对150篇科学论文的综合文献调查.
- 从环境样本中收集了ARG的定量PCR (qPCR) 数据.
- 分析了来自30个国家和12种样本类型的1594个样本的数据 (2001-2020年).
主要成果:
- 在受人类影响的环境中确定了典型的ARG丰度,从每16SrRNA的10^-5到10^-3副本.
- 这种丰富程度大致相当于每千个细菌中的一个ARG.
- 编制了全球ARG发生率和水平的全面概述.
结论:
- 这项研究为环境抗菌素耐药性监测提供了必要的背景数据.
- 建立的基线有助于检测偏离正常阻力水平的偏差.
- 这项工作支持当前和未来的AMR风险评估模型.
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