来自真菌的含有高纯化DNA的细胞包裹,用于PCR的直接使用
Vasily N Danilevich1, Sergey A Kozlov1, Vladimir V Sorokin2
1Shemyakin and Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry, Russian Academy of Science, Miklukho-Maklaya 16/10, Moscow, 117997, Russia.
Analytica chimica acta
|July 9, 2023
概括
一种新方法通过使细胞壁透,有效地为聚合酶链反应 (PCR) 准备真菌DNA. 这种简单,低成本的技术非常适合用于医学真菌学中的分子诊断.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 医学真菌学 医学真菌学
背景情况:
- 从真菌中有效提取DNA对于分子诊断至关重要.
- 刚性真菌细胞壁对DNA样本的准备构成了重大挑战.
- 现有的使用混沌基的方法对菌DNA隔离有局限性.
研究的目的:
- 开发一种新的,高效的程序,用于准备用于PCR的真菌DNA模板.
- 为了克服现有的真菌DNA提取方法的局限性.
- 创建一个简单,低成本的分子诊断方法.
主要方法:
- 在热剂和添加剂的水溶液中沸的真菌细胞.
- 使用含有尿素,二甲基硫酸盐 (SDS),氨和酸盐的混混合物.
- 通过电子显微镜和基因放大来评估细胞外的透性和DNA适合PCR.
主要成果:
- 开发了一种新的程序,用于生产具有DNA的透性真菌细胞包裹.
- 这种方法有效地去除了RNA和蛋白质,产生了纯化的DNA.
- 通过含有7M尿素,1%SDS,高达100mM氨和/或25mM酸的杂质溶液获得最佳结果.
- 电子显微镜证实了细胞壁松动,并成功实现了PCR放大各种真菌菌株的基因,包括Candida和Cryptococcus的临床分离物.
结论:
- 开发的方法提供了一种高效,简单,快速和低成本的方法,用于准备适合PCR的真菌DNA模板.
- 透的细胞外有助于DNA释放,克服细胞壁的障碍.
- 这种技术在真菌感染的分子诊断中具有很大的应用潜力.
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