神经电生理学数据库的比较
Priyanka Subash1, Alex Gray1, Misque Boswell1
1Laboratory of Neuro Imaging, USC Stevens Neuroimaging and Informatics Institute, Keck School of Medicine of USC, University of Southern California, 2025 Zonal Avenue, Los Angeles CA 90033.
ArXiv
|July 10, 2023
概括
本综述比较了四个开放访问的神经生理学数据档案,突出了它们的标准和分析工具. 它旨在指导研究人员选择有效的数据共享和神经信息学进步的平台.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 数据科学数据科学数据科学
背景情况:
- 在现代神经科学中,有效的数据共享和协作至关重要.
- 档案,标准和分析工具是成功共享数据的关键支柱.
研究的目的:
- 为了比较四个可自由使用的内神经电生理学数据库:DABI,DANDI,OpenNeuro和Brain-CODE.
- 描述提供用于存储,共享和重新分析人类和非人类神经生理学数据的工具的档案.
- 根据与神经科学界相关的标准来评估这些档案.
主要方法:
- 四个神经生理学数据库的比较审查.
- 对实施的数据标准 (BIDS,NWB) 的分析.
- 评估每个档案中可用的分析和可定制工具.
主要成果:
- 确定了四个主要的存储库:DABI,DANDI,OpenNeuro和Brain-CODE. 这四个主要的存储库是:DABI,DANDI,OpenNeuro和Brain-CODE.
- 观察到使用脑成像数据结构 (BIDS) 和无国界神经数据 (NWB) 标准的数据可访问性.
- 突出了库存中的各种分析工具,这些工具可以推进神经信息学.
结论:
- 选择的档案通过共同的标准和分析工具促进神经生理学数据共享和协作.
- 这些存储库对于推进神经信息学至关重要,因为它们支持大规模数据集成和分析.
- 研究人员可以利用这些平台来有效地存储,共享和重新分析神经生理学数据.
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