细胞暴露于乙乙胺除草剂诱导明显的蛋白质不稳定配置文件
Guy M Quanrud1, Ziqi Lyu1, Sunil V Balamurugan1
1Department of Chemistry, University of California, Riverside, California 92521, United States.
ACS chemical biology
|July 10, 2023
概括
乙尼化除草剂会损害蛋白质,导致错误折叠和蛋白质组不稳定. 一种新的Hsp40护送方法有效地识别这些除草剂破坏稳定的蛋白质,揭示了像GAPDH这样的特定点.
科学领域:
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 毒理学 毒理学 毒理学
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 乙尼化除草剂可以通过核友替代破坏细胞蛋白质,导致错误折叠和蛋白质稳定性破坏.
- 目前用于识别毒素与蛋白质相互作用的现有方法主要集中在直接结合上,对评估更广泛的蛋白质组不稳定性的方法有限.
研究的目的:
- 应用定量蛋白质组学方法,使用人类Hsp40伴侣突变体 (DNAJB8 H31Q) 来识别由酸乙胺除草剂破坏稳定的蛋白质.
- 为了比较Hsp40亲和度分析与基于活性的蛋白质分析 (ABPP) 在识别除草剂标中的有效性.
主要方法:
- 使用定量蛋白质组学分析了HEK293T细胞中酸乙胺诱导的蛋白质不稳定性.
- 使用DNAJB8 H31Q的Hsp40亲和度分析被用来捕获错误折叠的蛋白质.
- 基于活动的蛋白质概况 (ABPP) 用于比较.
主要成果:
- 暴露于酸盐,酸盐和酸盐诱导了许多细胞蛋白质的错误折叠,具有明显但重叠的配置.
- 蛋白质不稳定性集中在含有反应性半氨酸残留的蛋白质中,反应性是特异性的.
- 普罗帕克选择性地准了GAPDH和PARK7,降低了它们的细胞活动,并导致了总体的蛋白质聚合.
结论:
- Hsp40亲和度分析是一种有效的策略,用于识别因有毒物质暴露而破坏稳定的细胞蛋白.
- 与ABPP相比,这种方法确定了更广泛的除草剂目标范围.
- 普罗帕克对GAPDH在催化氨酸残留物中的修饰是直接结合导致蛋白质不稳定的例子.
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