合成肠道微生物注射剂的定量差异不会影响最终稳定的体外社区成分
Thiyagarajan Gnanasekaran1, Arjun Sarathi1, Qing Fang1
1Novo Nordisk Foundation Center for Basic Metabolic Research, Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen , Copenhagen, Denmark.
mSystems
|July 10, 2023
概括
在体外培养的合成肠道微生物群落 (SGMCs) 不需要精确的初始细胞比例. 平等的和类似人类的注射剂都汇聚到类似的稳定结构中,简化了未来的研究.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 肠道微生物组研究研究
- 合成生物学 合成生物学
背景情况:
- 使用合成肠道微生物群落 (SGMCs) 的体外研究对于理解肠道微生物群生态至关重要.
- 最初的注射剂定量成分对体外肠道微生物群落稳定性的影响在很大程度上仍未得到研究.
研究的目的:
- 为了确定SGMC注射剂的定量成分是否会在体外影响最终的稳定社区结构.
- 为了比较用相同比例接种的SGMCs的结果与反映平均人类便微生物组比例的结果.
主要方法:
- 两个114个成员的SGMC被建造:一个具有相等比例 (Eq) 和一个反映人类便比例 (Fec).
- 在多个阶段的体外肠道发酵器中培养SGMC,以两种不同的营养介质模拟近端和远端结肠状况.
- 微生物组合被分析使用16S rRNA基因扩增序列测序超过27天.
主要成果:
- 最初的注射剂组成并没有显著影响最终稳定的微生物群体结构.
- 营养介质解释了微生物组合的36%的差异.
- 在所有测试条件下,Eq和Fec接种剂都汇聚到类似的社区组成.
结论:
- 在不损害最终稳定的社区结构的情况下,可以简化SGMC注射剂的定量制备.
- 这些发现对简化体外SGMC研究和减少实验复杂性有重大影响.
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