漫游的甲基转移酶产生了一个马赛克表观遗传景观,并影响了 Bacteroides fragilis 群体的进化
Michael J Tisza1,2, Derek D N Smith1,3, Andrew E Clark4,5
1Bacterial Pathogenesis and Antimicrobial Resistance Unit, LCIM, NIAID, NIH, Bethesda, MD, USA.
细菌DNA甲基化多样性很大,特别是在Bacteroides fragilis群 (BFG) 中. 菌体基因流动显著驱动这种表观基因组变异,影响宿主-病原体相互作用.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 基因甲基化对细菌生理学至关重要,包括菌体防御和毒性.
- 尽管已知甲基转移酶,但细菌表观基因组多样性在很大程度上尚未被探索.
- 细菌菌群 (BFG) 是关键的肠道共生物和机会性病原体.
研究的目的:
- 为了研究细菌菌群 (BFG) 内的表观基因组多样性.
- 确定驱动BFG中DNA甲基化模式变化的来源.
主要方法:
- 使用长读测序对383个BFG分离物的泛基因组和泛基因组分析.
- 甲基转移酶基因的开采和与先导体的关联.
- 在BFG菌体中对基因流动的网络分析.
主要成果:
- BFG物种拥有数百种DNA甲基化基因,在大多数隔离物中具有独特的组合.
- 超过6000个甲基转移酶基因被确定,其中1000个与完整的prophages相关.
- 在BFG菌体中显著的基因流动表明在驱动表观基因组多样性方面发挥了作用.
结论:
- BFG表观基因组表现出巨大的多样性,在很大程度上是未有样本的多样性.
- 细菌菌体是BFG DNA甲基化模式变化的重要来源.
- 了解BFG表观遗传学对于管理共生作用和多药耐药性感染至关重要.
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