全副本识别和表达模式分析,以了解Trichosanthes kirilowii中AP2/ERF基因在发育和非生物应激中的作用
Rui Xiong1,2, Zhuannan Chu1,2, Xingxing Peng1,2
1Institute of Horticulture, Anhui Academy of Agricultural Sciences, Hefei, 230001, China.
BMC plant biology
|July 10, 2023
概括
研究人员在Trichosanthes kirilowii中确定了135个APETALA 2/乙烯响应元素结合因子 (AP2/ERF) 基因. 这些基因对花的发育和对冷和度等非生物压力的反应至关重要.
科学领域:
- 植物分子生物学 植物分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 植物生理学 植物生理学
背景情况:
- APETALA 2/乙烯反应元素结合因子 (AP2/ERF) 基因家族在植物激素信号传递和非生物应激反应中发挥作用.
- 三 (Trichosanthes kirilowii) 是一种经济重要作物,其AP2/ERF基因尚未进行先前研究.
研究的目的:
- 在T. kirilowii.中识别和描述AP2/ERF基因.
- 研究TkAP2/ERF基因在花朵发育,激素信号和非生物应激反应中的潜在作用.
主要方法:
- 生物信息分析被用来识别T. kirilowii基因组中的135个AP2/ERF基因.
- 进行了遗传学分析和基因结构分析.
- 共同表达网络是使用转录组数据构建的.
- 在各种压力条件和激素治疗下,使用RNA测序 (RNA-seq) 和定量实时PCR (qRT-PCR) 分析基因表达.
主要成果:
- 135个TkERF基因被确定并分为4个子家族和13个组.
- 分析显示,大多数TkERF基因经历了净化选择.
- 同表达分析表明,AP2/ERF基因与乙烯,吉伯雷林和酸信号通路之间存在相关性.
- 表达分析显示,在非生物性压力 (冷,PEG,NaCl) 和激素治疗 (ETH,GA3,ABA) 下,TkERF基因的差异调节.
结论:
- 这项研究在T. kirilowii.中发现了一大批AP2/ERF基因家族.
- TkAP2/ERF基因在花的发育和对非生物压力的反应中起重要作用.
- 这项研究为未来的功能研究和T. kirilowii的遗传改进提供了基础.
关键词:
在AP2/ERF的基础上.无生物应激应激是一种非生物应激.表达方式表达方式表达方式表达方式表达方式表达方式表达方式表达方式表达方式表达方式表达方式表达方式表达方式植物激素植物激素三三生 (Trichosanthes kirilowiiwii) 是一种植物.更多相关视频
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