将开放的光谱数据添加到MassBank和PubChem中,使用开源工具支持混合物的非目标暴露学
Anjana Elapavalore1, Todor Kondić1, Randolph R Singh1,2
1Luxembourg Centre for Systems Biomedicine (LCSB), University of Luxembourg, 6 Avenue du Swing, 4367, Belvaux, Luxembourg. anjana.elapavalore@uni.lu.
这项研究通过为MassBank开放的图书馆提供超过5500个质谱来增强暴露组研究中的化学识别. 这一努力改善了对环境暴露及其对人类健康的影响的分析.
科学领域:
- 环境健康 环境健康
- 化学信息学 化学信息学
- 分析化学是一种分析化学.
背景情况:
- 暴露组包括整个生命中的所有环境暴露,对人类健康构成风险.
- 质谱测量对于识别环境压力因素至关重要,但由于巨大的化学多样性和有限的光谱库,它面临着挑战.
- 改进化学物质识别对于将暴露与健康结果联系起来至关重要.
研究的目的:
- 扩大开放的光谱数据用于曝光学研究.
- 加强化学品在环境和健康研究中的识别.
- 为了促进精选的质谱数据的共享.
主要方法:
- 为MassBank图书馆提供毒理学相关化学品的实验性质谱.
- 使用开源R包 (RMassBank,Shinyscreen) 进行数据处理和存储.
- 在PubChem.中开发一个用于存储和注释光谱的自动化工作流.
主要成果:
- 从783个化合物中添加了5582个光谱到MassBank,使其他开放的光谱库受益.
- 与PubChem建立了一个自动化存储和注释工作流程,以提高数据可访问性.
- 新的光谱数据已经在曝光学研究中提高了对化学物质识别的信心.
结论:
- 开放光谱数据的贡献有助于显著化学物质在曝光学识别.
- 增强的光谱图书馆和数据共享对于推动环境健康研究至关重要.
- 自动化工作流程简化了科学界的数据集成和可访问性.
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