分享来自艾伦大脑天文台的神经生理学数据
Saskia E J de Vries1, Joshua H Siegle1, Christof Koch1
1Allen Institute, Seattle, United States.
eLife
|July 11, 2023
概括
系统神经科学中的开放数据共享对于科学信任至关重要,但仍然很少见. 艾伦大脑天文台 (Allen Brain Observatory) 展示了共享神经元活动数据的价值,导致了100多篇出版物,并确定了更广泛的数据再利用障碍.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 数据科学数据科学数据科学
- 科学出版科学出版
背景情况:
- 皇家学会的座右铭是"Nullius in verba",强调经验验证胜过权威.
- 现代科学复杂性需要共享数据以实现可复制性和信任性.
- 开放的数据共享尚未成为系统神经科学中的标准实践.
研究的目的:
- 评估艾伦大脑天文台在共享系统神经科学数据方面的倡议.
- 突出开放数据对科学发现和验证的影响.
- 确定挑战,并提出改善神经科学数据共享的解决方案.
主要方法:
- 来自艾伦大脑观测中心在小鼠中进行的神经活动调查的数据和元数据的分析.
- 审查使用共享数据的出版物和预印件.
- 提炼关于开放数据实践和重复使用的经验教训.
主要成果:
- 来自艾伦大脑天文台的数据促进了新的发现,计算算法验证和比较分析.
- 开放数据倡议已经产生了100多份出版物和预印件.
- 在系统神经科学中确定了数据共享和重复使用的具体障碍.
结论:
- 开放的数据共享,以艾伦大脑天文台为例,显著提高了科学可重现性和发现性.
- 解决已识别的障碍对于在系统神经科学中更广泛采用开放数据实践至关重要.
- 对数据共享的持续努力对于经验科学的进步至关重要.
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