通过对Bemisia tabaci (Gennadius) 株的基因组水平比较来确定潜在的抗虫剂耐药性标记物
Hua-Ling Wang1,2, Qiong Rao3, Zhen-Zhu Chen1
1College of Forestry, Hebei Agricultural University, Hebei, China.
Archives of insect biochemistry and physiology
|July 12, 2023
概括
基因组分析揭示了侵入性白 (Bemisia tabaci) MED的显著遗传差异,确定了与抗虫剂耐药性相关的新变异. 这些发现对于制定针对性害虫管理策略来对抗这种破坏性农业害虫至关重要.
科学领域:
- 农业昆虫学 农业昆虫学
- 基因组学就是基因组学.
- 虫害管理 虫害管理 虫害管理
背景情况:
- 侵入性白 (Bemisia tabaci) MED是一种主要的农业害虫,造成了严重的经济损失.
- 数十年的杀虫剂使用导致了B. tabaci MED种群的广泛耐药性.
- 这种抗杀虫剂耐药性的遗传基础在很大程度上仍然未知.
研究的目的:
- 在耐昆虫剂和易受昆虫剂的Bemisia tabaci MED系列中对单核酸多态性 (SNP) 进行全基因组的比较分析.
- 确定与抗虫剂耐药性相关的遗传变异和途径.
- 为开发抗昆虫剂耐药性链接的局部阵列提供资源.
主要方法:
- 来自最近感染的田地和易受感染的1976年线的单个白的低覆盖基因组测序.
- 使用可用的B. tabaci MED基因组作为参考,对SNP数据进行比较分析.
- 主要成分分析 (PCA) 用于识别遗传差异.
主要成果:
- 在耐药和易感的MED白系之间观察到显著的遗传差异.
- 确定了基因本体学 (GO) 关键类别和基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 途径,这些途径可能与抗虫剂耐药性有关.
- 在编码Cytochrome P450s,UGTs,GSTs,酶,ABC载体和皮肤蛋白的基因中发现了新的变异.
结论:
- 这项研究发现了贝米西亚 (Bemisia tabaci MED.) 昆虫杀虫剂耐药性背后的显著遗传变异.
- 发现了几种与耐药性相关的新型遗传位置和途径.
- 建议使用农药生物测试和奥米克数据集进行进一步的验证,以确认用于害虫控制的已识别的标记物.
