对Purpureocillium sp.进行深度比较转录组分析. 在应激下CB1
Aslıhan Kurt-Kızıldoğan1, Çiğdem Otur2, Kubilay Yıldırım3
1Department of Agricultural Biotechnology, Faculty of Agriculture, Ondokuz Mayıs University, 55139, Samsun, Turkey. aslihan.kizildogan@omu.edu.tr.
Applied microbiology and biotechnology
|July 12, 2023
概括
使用Purpureocillium sp.进行真菌生物修复. 在转录组水平上,CB1显示出显著的 (Cd) 反应. 这项研究揭示了参与Cd排毒和碳化合物降解的关键基因和途径,增强了其生物修复潜力.
科学领域:
- 环境微生物学环境微生物学
- 菌类学 菌类学是指菌类学.
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- 菌生物修复为减轻环境污染提供了一种可持续的方法.
- (Cd) 污染对生态和健康构成重大风险.
- 了解真菌对重金属的反应对于开发有效的补救策略至关重要.
研究的目的:
- 为了研究Purpureocillium sp.的转录组级反应. CB1到 (Cd) 的压力.
- 确定参与CD耐受性和解毒的基因和途径.
- 为了评估Purpureocillium sp.的潜力. CB1用于Cd和柴油的同时生物修复.
主要方法:
- 菌菌株的隔离和鉴定 (Purpureocillium sp. 菌菌株的分离和鉴定) (一) 收藏 收藏 收藏 收藏 收藏 收藏 收藏 收藏
- 在不同时间点 (6小时和36小时) 对Cd2+ (500和2500毫克/升) 的不同度暴露真菌培养物.
- 使用RNA测序 (RNA-seq) 的转录组分析和用反转录酶-定量聚合酶链反应 (RT-qPCR) 的验证.
- 评估Cd被真菌生物质吸附以及提取物的抗真菌活性.
主要成果:
- RNA-seq确定了620个共同表达的基因,并揭示了在Cd压力下显著的差异性基因表达,特别是在2500 mg/LCd2+的前6小时内.
- 观察到参与酸盐基酶活性 (纳弗他林生物降解) 和碳化合物降解途径的基因的升级,即使柴油作为碳源.
- Cd2+主要被吸附在细胞壁上,证实了吸附潜力,而Cd压力导致了生长减缓和菌形.
- 在Cd压力下,leucinostatin基因表达增加,受治疗的培养物提取物表现出增强的抗真菌活性.
结论:
- 这项研究提供了Purpureocillium sp.的第一个转录组分析. 在Cd压力下,阐明了关键的分子机制.
- 这些发现突出了酸盐氧化酶和碳化合物降解途径的上调,表明了Cd和柴油的双重生物修复能力.
- 紫色菌种 (Purpureocillium sp.) 是一种的植物. CB1在压力下表现出显著的Cd吸附潜力和增强的抗真菌特性,使其成为生物修复工程的有希望的候选人.
