用临床相关的药物暴露量对来自患者的瘤细胞进行全癌症药物基因组分析

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 基因组学就是基因组学.
• 药理学 药理学是指药理学的学科.

背景情况:

• 瘤异质性和固体癌症中的多个分子缺陷需要对遗传和药理学因素进行全面的评估,以获得有效的精准医学.
• 患者衍生异种移植 (PDX) 和患者衍生异种移植培养 (PDXC) 模型密切模仿患者瘤,使详细的药物基因组分析成为可能.

研究的目的:

• 评估PDX和PDXC模型在预测患者对抗瘤药物的反应方面的有用性.
• 根据体突变和药物敏感性数据开发逻辑模型来预测药物反应.

主要方法:

• 下一代测序 (NGS) 用于分析四种癌症类型的23个匹配的患者瘤和PDX样本中的体质突变.
• 19种抗瘤药物与78种患者衍生瘤培养物 (PDXC) 进行了选,使用临床相关的药物暴露量.
• 在PDXC中使用二元化值敏感性分类来预测体内药物反应 (PDX),并开发逻辑模型来将突变与反应相关联.

主要成果:

• 患者瘤和PDX模型之间的体突变的一致性随着变异性等位基因频率的增加而增加.
• 在个别PDXC模型和跨癌症谱系中确定了特定的药物反应.
• 在PDXC中观察到的药物反应在PDX模型中成功地在体内复制,逻辑建模确定了可预测反应的关键体质突变.

结论:

• 整合患者瘤的NGS,高通量药物查和逻辑建模,为了解和预测癌症治疗药物反应提供了一个强大的平台.
• PDX和PDXC模型是全面的药物基因组分析和推进精确瘤学的宝贵工具.