对不同年龄的野生模拟人参进行比较转录组分析,揭示了人参积的可能机制
Jaewook Kim1, Yeongbae Yun2, Jeonghoon Huh2
1Department of Biological Sciences, Chungnam National University, Daejeon, 34134, Republic of Korea.
Plant physiology and biochemistry : PPB
|July 13, 2023
概括
较老的野生模拟人参由于转录基因变化而积累了更多的人参. 在老年人参中,防御和莉酸通路被激活,可能有助于轻微的人参酸生物合成.
科学领域:
- * 植物生物学 植物生物学
- * 分子遗传学 分子遗传学
- * 药物鉴定学 药物鉴定学 药物鉴定学
背景情况:
- * 帕纳克斯人参是一种重要的亚洲药用植物.
- *山地种植的人参由于寿命较长而表现出更高的人参化物含量.
- * 老化野生仿真人参的形态变化是微妙的,需要分子识别.
研究的目的:
- * 阐明在老年野生仿真人参中,人参化物积累背后的转录基因机制.
- * 为了比较7岁和13岁野生仿真人参之间的基因表达特征.
- * 为了确定叶子,芽和根组织中与年龄相关的基因表达差异.
主要方法:
- *对来自7岁和13岁野生仿真人参的叶子,芽和根组织进行比较转录组分析.
- *差异基因表达分析以确定559个差异表达基因 (DEG).
- *功能丰富分析和定量实时PCR (qRT-PCR) 验证.
主要成果:
- * 观察到与年龄相关的显著转录组变化,其中280种叶子,103种芽和164种根主导的DEGs.
- * 在7年老的人参叶子中,酸和酸路径被上调.
- *在13岁的人参根中,对防御反应的基因被上调,在侧根中,对莉酸反应的基因和UGTs被上调.
结论:
- *转录组分析揭示了Panax人参中依赖年龄的基因表达模式.
- * 老人参中防御和莉酸通路的升级表明在人参积中发挥了作用.
- *环境因素,如山区的细菌刺激,可能会影响基因表达和人参酸生物合成.


