基于与CRISPRCas12a系统相关的LAMP检测的SARS-CoV-2的快速检测
Karoline Almeida Felix de Sousa1,2, Carolina Kymie Vasques Nonaka2,3, Ricardo Khouri1,4
1Gonçalo Moniz Institute, Oswaldo Cruz Foundation (FIOCRUZ), Salvador 40296-710, Brazil.
Diagnostics (Basel, Switzerland)
|July 14, 2023
概括
一个新的基于CRISPR的测试可以准确检测SARS-CoV-2,为COVID-19测试提供了一个快速而有前途的替代方案,特别是在资源有限的环境中. 这种诊断方法与现有的PCR测试具有很高的一致性.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 传染性疾病 传染性疾病
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- 在全球范围内,COVID-19大流行突出了对可访问的SARS-CoV-2测试的迫切需要.
- 大规模测试实施的挑战,特别是在低收入国家,需要快速准确的诊断解决方案.
- 基于CRISPR的临床检测显示出高灵敏度和快速检测SARS-CoV-2的潜力.
研究的目的:
- 评估基于CRISPR的测试系统的性能,用于检测SARS-CoV-2.
- 为了比较CRISPR检测的准确性和灵敏度与已建立的RT-PCR方法.
主要方法:
- 评估29个鼻样本,包括疑似COVID-19病例和其他呼吸道病毒.
- 使用LAMP技术扩大ORF1ab基因.
- 用Gemini XPS光阅读器分析结果,并与RT-PCR进行比较.
主要成果:
- 在RT-LAMP-CRISPR/Cas12测定显示100%的一致性与RT-PCR.
- CRISPR/Cas12系统的检测极限为15.6 PFU/ml,而RT-PCR的检测极限为0.01 PFU/ml.
- 克里斯普尔/卡斯12敏感度为84个RNA拷贝/μL,而RT-PCR敏感度约为8个RNA拷贝/μL.
结论:
- RT-LAMP-CRISPR/Cas12a试验是SARS-CoV-2检测的一个有希望的替代方案.
- 基于CRISPR的诊断技术为快速准确的传染病检测提供了一个可行的选择.
