尿液miRNA分析的数据规范化从头癌患者的尿液miRNA分析,这些患者接受了西斯普拉丁治疗

科学领域:

• 生物化学 生物化学
• 在瘤学瘤学.
• 分子生物学分子生物学

背景情况:

• 通过qRT-PCR精确的微RNA (miRNA) 分析依赖于适当的规范化.
• 目前缺乏用于miRNA定量化的通用参考基因.
• 用西斯普拉丁化学放射治疗的头癌患者容易发生毒性.

研究的目的:

• 确定最佳的内源性正常化剂,用于在接受西斯普拉丁化疗或放射治疗的头癌患者的尿路miRNAs的相对量化.
• 根据RNA测序数据和特定标准评估候选规范化剂.

主要方法:

• 用RNA测序来比较在有或没有西斯甲基毒性患者中的miRNA表达.
• 候选规范化剂是根据表达水平,折叠变化,p值和特定分析软件中没有评论而选择的.
• 在一个较大的患者队列中,使用定量逆转录聚合酶连锁反应 (qRT-PCR) 验证了选择的候选miRNA.

主要成果:

• 四种miRNAs (hsa-miR-363-5p,hsa-miR-875-5p,hsa-miR-4302和hsa-miR-6749-5p) 符合最初的选择标准.
• 只有hsa-miR-875-5p在验证队列中的两个患者组之间显示不变的表达.
• hsa-miR-875-5p被证明是这种特定的实验条件的适当正常化剂.

结论:

• hsa-miR-875-5p是一种可靠的内源性正常化剂,用于头癌患者的miRNA表达研究,这些患者经历了西斯普拉丁诱导的毒性.
• 这一发现有助于在瘤学中更准确地发现基于miRNA的生物标志物和监测治疗.