简单的方法诱导生产,隔离,识别和测试来自蛋白质细菌的自然产品
Edna Bode1, Daniela Assmann1, Petra Happel1
1Department of Natural Products in Organismic Interactions, Max Planck Institute for Terrestrial Microbiology, Marburg, Germany.
Bio-protocol
|July 14, 2023
概括
该easyPACId方法激活自然产品基因集群在像Xenorhabdus和Photorhabdus这样的细菌中. 这通过将提取物与特定分子丰富而简化化合物发现和测试.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 自然产品化学 自然产品化学
- 合成生物学 合成生物学
背景情况:
- 生物合成基因集群 (BGCs) 编码有价值的自然产品,但通常很难激活.
- 昆虫病原性细菌Xenorhabdus和Photorhabdus产生各种生物活性化合物.
- 目前用于发现天然产品的方法在激活,表达和净化方面面临挑战.
研究的目的:
- 介绍easyPACId (简单的促进者激活和化合物识别) 方法,用于针对性地激活BGCs.
- 为了证明easyPACId在肠病原菌Xenorhabdus和Photorhabdus中的实用性.
- 简化自然产品发现和表征的过程.
主要方法:
- 针对编码NRPS,PKS或混合合成酶的BGC的有针对性的激活.
- 在∆hfq突变体中,与L-氨酸可诱导的PBAD促进体交换原生促进体.
- 在Xenorhabdus和Photorhabdus中应用,适应Pseudomonas entomophila.
主要成果:
- 用单个化合物或化合物类丰富原油提取物.
- 由于∆hfq菌株的背景减少,自然产品的分离和识别简化.
- 在多种蛋白质细菌中成功应用,促进对标生物的直接测试.
结论:
- 易PACId提供了一种有效的策略来激活无声或神秘的BGC.
- 该方法绕过了与异质表达和化学合成相关的问题.
- 易PACId促进了从微生物来源发现和开发新的天然产品.
关键词:
生物活性化合物的隔离.生物活性测试试验 生物活性测试生物合成基因集群激活活化在此之前,NRPS是NRPS.自然产品是一种自然产品.在PKS中,PKS是PKS.摄影工作室的摄影师.活动主办人交流活动伪omonas 是一个类型的.在Xenorhabdus中使用Xenorhabdus.简单的 简单的 简单的更多相关视频
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