从受感染的 rhesus macaques 的多个器官中 SARS-CoV-2 变种的不同转录组景观
Tingfu Du1, Chunchun Gao2, Shuaiyao Lu3
1National Kunming High-level Biosafety Primate Research Center, Institute of Medical Biology, Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College, Kunming 650118, China; State Key Laboratory of Medical Molecular Biology, Department of Molecular Biology and Biochemistry, Institute of Basic Medical Sciences, Medical Primate Research Center, Neuroscience Center, Chinese Academy of Medical Sciences, School of Basic Medicine, Peking Union Medical College, Beijing 100005, China.
最初的SARS-CoV-2菌株引发了比其变种更强的免疫反应. 变种增加了病毒RNA,可能阻碍抗病毒防御,而原始菌株和阿尔法变种在 rhesus macaques 中引起了更大的组织RNA 变化.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 文字转录学 (Transcriptomics) 是一个学科.
背景情况:
- 由SARS-CoV-2引起的COVID-19大流行导致了重大的全球健康和经济挑战.
- 新出现的SARS-CoV-2令人担忧的变种 (VOCs) 复杂了感染动态和疾病严重程度.
研究的目的:
- 为了在体外比较原始SARS-CoV-2菌株及其VOCs (Alpha,Beta,Delta) 的病毒学特征.
- 为了研究感染这些菌株的 rhesus 的多个器官中的差异性转录组变化.
- 为了阐明早期的COVID-19病原体.
主要方法:
- 在实验室中对SARS-CoV-2菌株和VOC进行病毒学表征.
- 从受感染的 rhesus macaques 的肺部,右心室,血液,大脑皮质和小脑组织的转录组分析.
- 对RNA丰度和免疫反应标记物的比较分析.
主要成果:
- 与VOC相比,原来的SARS-CoV-2菌株在宿主细胞中诱导了更强大的先天免疫反应.
- 挥发性有机化合物显著提高了亚基因组RNAs (N,Orf9b,Orf6,Orf7ab) 的水平,这些已知的先天免疫抗剂.
- 原始菌株和阿尔法变体在 rhesus 的组织中引起了比Beta 和 Delta 变体更大的RNA 变化.
- 在右心室观察到超炎症状态和活跃的免疫反应,由高调节的炎症和免疫相关RNAs表明.
- 周围血液可能在组织间信号传递和协调分子反应中发挥作用.
结论:
- 早期的COVID-19病原发生在原来的SARS-CoV-2菌株及其VOC之间有所不同.
- 挥发性有机化合物可以通过增加病毒RNA水平更有效地逃避天生的免疫力.
- 心脏 (右心室) 是一个目标器官,表现出炎症和免疫激活.
- 在 rhesus macaques 中的转录基因分析提供了对宿主-病原体相互作用和对 SARS-CoV-2 感染的系统反应的见解.
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