从桑达斯基湾,埃里湖的Planktothrix特定的蓝菌序列的多年分子量化和'omics分析

科学领域:

• 环境微生物学环境微生物学
• 水生病毒学水生病毒学
• 有害的藻类繁殖动力学

背景情况:

• 普兰克托特里克斯·阿加迪 (Planktothrix agardhii) 是埃里湖桑达斯基湾的一个微囊素生产的蓝藻细菌.
• 蓝菌对于控制有害的藻类繁殖 (HABs) 是至关重要的.
• 已知很少有特定于Planktothrix的蓝菌,其中PaV-LD是最受研究的.

研究的目的:

• 在桑达斯基湾的Planktothrix特定的蓝菌体的特征.
• 了解蓝细胞在调节P. agardhii花中的作用.
• 开发对蓝菌诱导的溶解事件的监测方法.

主要方法:

• 病毒序列的元基因组和转录组分析.
• 通过CRISPR间隔符匹配来识别宿主病毒.
• 定量PCR (qPCR) 检测病毒的数量和基因表达.

主要成果:

• 确定了与PaV-LD和潜在的新型Planktothrix蓝菌相关的病毒序列.
• 在2015-2019年期间,PaV-LD类蓝菌很丰富.
• 转录组数据显示,尽管病毒的丰富性很高,但病毒基因表达低.

结论:

• 桑达斯基湾是Planktothrix特定的蓝菌体的所在地.
• 蓝虫的丰富性与高基因表达没有直接相关.
• 需要进一步的研究来阐明蓝体在HAB调节中的作用.