基于scRNA-seq和批量-seq探索乳腺癌中的PANoptosis
Puxing He1, Yixuan Ma2, Yaolu Wu1
1Department of Thyroid and Breast Surgery, Affiliated Hospital of Yan 'an University, Yan'an, Shaanxi, China.
Frontiers in endocrinology
|July 17, 2023
概括
细胞死亡途径PANoptosis对乳腺癌产生影响. 使用PANoptosis基因的新模型预测了患者的生存和免疫透,为新型免疫疗法提供了潜力.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 细胞死亡途径 细胞死亡途径
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- PANoptosis,涉及热,光和死,在恶性瘤中至关重要.
- 在乳腺癌中PANoptosis的作用仍未得到充分研究.
研究的目的:
- 为了研究PANoptosis在乳腺癌中的作用.
- 开发基于PANoptosis相关基因的乳腺癌患者的预后模型.
- 探索乳腺癌中PANoptosis,免疫透和微卫星不稳定性之间的关系.
主要方法:
- 下载的乳腺癌数据集 (GEO,TCGA).
- 使用COX和LASSO回归来确定与PANoptosis相关的基因,用于预后模型的构建.
- 进行了免疫透分析和功能差异分析.
主要成果:
- 一个预后模型将患者分为不同生存结果的风险组 (P <0.05).
- 较低风险的群体表现出更高的免疫透和免疫检查点基因表达.
- 更高的微卫星不稳定性 (MSI) 与较低的风险得分相关.
- 放射素 (RDX) 被确定为参与免疫反应和扩散的关键预后基因.
结论:
- 基于PANoptosis的分子聚类和预后特征可以预测乳腺癌患者的生存率.
- 这项研究加深了对乳腺癌中PANoptosis的理解,表明了新的免疫治疗策略的潜力.
更多相关视频
11:12Optimization of a Multiplex RNA-based Expression Assay Using Breast Cancer Archival Material
Published on: August 1, 2018
8.1K
13:24Integration of Wet and Dry Bench Processes Optimizes Targeted Next-generation Sequencing of Low-quality and Low-quantity Tumor Biopsies
Published on: April 11, 2016
11.9K
