从大肠杆菌中大规模净化III型毒素-抗毒素核蛋白复合物及其成分,用于生物物理研究
Parthasarathy Manikandan1, Kavyashree Nadig1, Mahavir Singh1
1Molecular Biophysics Unit, Indian Institute of Science, Bengaluru, 560012, India.
Bio-protocol
|July 17, 2023
概括
我们优化了一种方法来从大肠杆菌中净化III型毒素-抗毒素 (TA) 复合物,产生大量TA RNP复合物,自由毒素和抗毒素RNA用于生物物理研究.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 分子生物学分子生物学
- 结构生物学 结构生物学
背景情况:
- 毒素-抗毒素 (TA) 系统是重要的细菌免疫机制,III型系统利用RNA抗毒素和蛋白质毒素.
- 在肠道微生物群和病原体中发现了III型TA系统,为新的抗菌策略提供了潜力.
- 从大肠杆菌中净化III型TA成分是具有挑战性的,因为毒素有毒性,通常需要对核糖核蛋白 (RNP) 复合体进行共同净化.
研究的目的:
- 优化来自大肠杆菌的III型TA复合物的联合表达和净化.
- 为了获得足够数量的TA RNP复合物,自由毒素和自由抗毒素RNA,用于生物物理和结构分析.
- 为NMR光谱学研究开发可适应同位素标记的协议.
主要方法:
- 优化E. coli中TOXIN III型TA复合物的共表达和净化方案.
- 大规模的净化产生了毫克数量的TA RNP复合物,无毒素和抗毒素RNA.
- 为NMR研究生产同位素标记组件的协议的调整.
主要成果:
- 成功大规模净化III型TA RNP复合物,无毒素和无毒素抗毒素RNA.
- 获得了适合生物物理和结构研究的净化成分的毫克数量.
- 已证明适应性,用于生产同位素标记样品,用于NMR等先进技术.
结论:
- 优化的协议可以有效地净化来自大肠杆菌的III型TA组件.
- 该方法为结构和生物物理特征 (NMR,ITC,X射线晶体学) 提供了充足的材料.
- 这项工作有助于进一步研究III型TA系统的功能和潜在的治疗应用.
更多相关视频
10:50Using In Vitro Fluorescence Resonance Energy Transfer to Study the Dynamics Of Protein Complexes at a Millisecond Time Scale
Published on: March 14, 2019
8.2K
09:56Scalable Isolation and Purification of Extracellular Vesicles from Escherichia coli and Other Bacteria
Published on: October 13, 2021
3.9K
