一种基于机器学习的乳腺癌中与二硫化相关的新表达模式
Zhitang Wang1, Xianqiang Du1, Weibin Lian1
1Department of Breast, The First Hospital of Quanzhou Affiliated to Fujian Medical University, Quanzhou, China.
Frontiers in genetics
|July 17, 2023
概括
这项研究发现了乳腺癌 (BC) 的新型预后特征,该特征基于与二硫化相关的基因. 这种特征准确地预测了患者的结果,并与瘤微环境相关联,提供了新的治疗见解.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 遗传学 遗传学 是一个
背景情况:
- 乳腺癌 (BC) 是全球癌症相关死亡的主要原因.
- 作为一种新型细胞死亡途径的二硫化的作用在BC的预后和治疗中仍然未被探索.
研究的目的:
- 调查乳腺癌中二硫化的生物功能和预后价值.
- 根据与二硫化相关的基因开发BC的预后特征.
主要方法:
- 在dissulfidptosis基因中评估了基因突变和CNV.
- 进行差异表达,预后和考克斯分析以确定BC特定的DRG.
- 利用无监督聚类和LASSO回归来开发预后特征.
- 分析了这种特征与TME的相关性,免疫透,干性和药物敏感性.
主要成果:
- 根据三个DRG (DNUFS1,LRPPRC,SLC7A11) 确定了两个不同的集群,其中A集群显示出更好的生存率和更高的免疫透率.
- 开发了一个具有良好的预测能力的四个基因预后特征 (KIF21A,APOD,ALOX15B,ELOVL2).
- 该签名与TME,免疫细胞透,TMB,干性和药物敏感性有很强的相关性.
结论:
- 一个基于dissulfidptosis-DEGs的预后签名有效地预测BC患者的预后.
- 这种特征与瘤微环境密切相关,表明了潜在的治疗策略.
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