在低温应力下对两种西兰花 (Oreochromis niloticus和Oreochromis aureus) 之间的定量光蛋白质组的比较分析
Changgeng Yang1, Hua Fan1, Liya Ge1
1Life Science & Technology School, Lingnan Normal University, Zhanjiang, China.
PeerJ
|July 17, 2023
概括
鱼菌株由于蛋白质酸化的变化而表现出不同的低温耐受性. 这项研究揭示了脂质代谢,细胞亡和免疫反应的关键生理差异,有助于开发耐寒的鱼物种.
科学领域:
- 水产养殖是水产养殖的一种方式.
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 鱼类生理学 鱼类生理学
背景情况:
- 鱼是一种重要的养殖鱼,对低温的耐受性很差.
- 不同的鱼菌株之间存在着对低温耐受性的显著差异.
研究的目的:
- 为了比较分析两种带有不同耐寒性的鱼菌株的蛋白组.
- 阐明底层鱼对低温压力的反应的分子机制.
主要方法:
- 使用 iTRAQ (相对和绝对量化等离子标签) 方法进行定量蛋白质组学.
- 对差异化蛋白进行了基因本体学 (GO) 和InterPro (IPR) 分析.
- 使用基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 路径丰富分析.
主要成果:
- 在寒冷压力下,在两种鱼菌株的生理活动和调节效应中发现了相似之处.
- 不同化蛋白主要参与脂质代谢,细胞增殖和亡.
- 在 *Oreochromis aureus* 中观察到细胞因子-细胞因子受体相互作用途径内的免疫和生长相关蛋白质的突出变化.
- 突出了碳水化合物消化和吸收途径在*Oreochromis niloticus*中的丰富,这表明对能量代谢的影响更大.
结论:
- 蛋白质酸化,表达和修饰水平的差异有助于在鱼菌株之间产生不同的低温耐受性.
- 低温压力显著影响脂质新陈代谢,细胞亡,和免疫/生长途径在鱼.
- 这些发现为开发水产养殖中耐寒性提升的鱼菌株提供了洞察力.
