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Updated: Jul 25, 2026
08:50
Predictive Immune Modeling of Solid Tumors
Published on: February 25, 2020
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在肝细胞癌中,基于未折叠蛋白反应 (UPR) 相关的分子亚型的免疫原性景观和风险评分预测
Hanyao Guo1, Sidi Zhang1, Bo Zhang1
1Ministry of Education Key Laboratory of Molecular and Cellular Biology; Hebei Research Center of the Basic Discipline of Cell Biology, Hebei Province Key Laboratory of Animal Physiology, Biochemistry and Molecular Biology, College of Life Sciences, Hebei Normal University, Shijiazhuang, Hebei, China.
Frontiers in immunology
|July 17, 2023
概括
这项研究确定了四个关键的展开蛋白质反应基因 (URG),可以预测肝细胞癌 (HCC) 患者的预后和对索拉芬尼治疗的敏感性,为HCC提供新的治疗点.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 遗传学 遗传学 是一个
背景情况:
- 肝细胞癌 (HCC) 是全球癌症相关死亡的主要原因,其特点是复杂的分子机制和异质性,阻碍了有效的预后和向治疗.
- 展开的蛋白质响应 (UPR),对内分泌网膜稳定至关重要,与HCC恶性瘤有关,包括侵入性和治疗耐药性.
- 识别HCC的新预后指标和治疗目标对于改善临床结果至关重要.
研究的目的:
- 通过使用UPR相关基因 (URG) 识别HCC的新预后指标.
- 为HCC患者建立基于URG的预后模型.
- 探索URG作为HCC药物治疗目标的潜力.
主要方法:
- 从TCGA,ICGC和GEO数据库下载了基因表达特征和临床数据.
- 利用共识聚类来分类URG分子亚型,并使用单变Cox回归和LASSO算法来开发预后模型.
- 使用Kaplan-Meier和ROC分析评估预后性能,并使用TIMER和XCell算法调查URG-免疫细胞透关系. 实时PCR分析了索拉费尼布对URG表达的影响.
主要成果:
- 大多数URG在HCC上调;确定了两个不同的URG表达集群,其中集群1显示出更高的URG表达,更差的预后和增加的免疫抑制因素.
- 建立了一个基于四个关键URG (ATF4,GOSR2,PDIA6,SRPRB) 的预后模型,证明高风险得分与更差的临床预后相关.
- 患有高URG表达的患者表现出对索拉菲尼布的敏感性增加;在索拉菲尼布治疗的HCC细胞中,ATF4被调高,而GOSR2,PDIA6和SRPRB被调低.
结论:
- 开发的与UPR相关的预后签名,包括四个URG,显示出评估化学疗法/免疫疗法疗效和HCC临床预后的重大潜力.
- 这个签名可以帮助分层HCC患者进行个性化治疗策略.
- 该研究强调了UPR在HCC进展和治疗反应中的作用,并建议特定的URG作为潜在的治疗点.
