检测SARS-CoV-2 BA.2 ,BA.4 和 BA.5 变种使用强大的基于RT-RPA-CRISPR/Cas12a的方法 - - 中国,2023年
Meihui Luo1, Yang Pan2, Yaqing He3
1MHC Key Laboratory of Biosafety, National Institute for Viral Disease Control and Prevention, China CDC, Beijing, China.
China CDC weekly
|July 17, 2023
概括
一种新的CRISPR/Cas12a测定方法可以快速准确地检测SARS-CoV-2的Omicron变种BA.2,BA.4和BA.5.5. 这种方法为追踪新出现的COVID-19菌株提供了高灵敏度和特异性.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 病毒学 病毒学
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- 像Omicron这样的SARS-CoV-2令人担忧的变种 (VOC) 的出现需要快速检测方法.
- 准确识别特定的SARS-CoV-2菌株对于疫情控制至关重要.
研究的目的:
- 开发和验证SARS-CoV-2 Omicron变种BA.2,BA.4和BA.5.5的快速,准确的检测技术.
- 用临床样本评估开发的试验的灵敏度和特异性.
主要方法:
- 使用逆转录-重组酶聚合酶放大 (RT-RPA) 与CRISPR/Cas12a系统相结合.
- 验证了检测特定SARS-CoV-2 Omicron亚型 (BA.2,BA.4,BA.5) 的测定方法.
主要成果:
- 达到的检测极限为BA.2的10副本/μL,BA.4的1副本/μL和BA.5.5的10副本/μL.
- 在46个临床样本中表现出高灵敏度 (90%-100%) 和100%的特异性.
- 成功地区分了三个Omicron亚型.
结论:
- 该CRISPR/Cas12a试验提供了一种快速可靠的方法来检测和区分SARS-CoV-2的Omicron变体.
- 这种技术可以帮助监测新型SARS-CoV-2菌株的出现和传播.
