一种多平台的代谢学方法,用于对具有各种KIT突变的GIST异种移植进行全面分析

科学领域:

• 生物化学和分子生物学
• 分析化学 分析化学
• 在瘤学瘤学.

背景情况:

• 非定位代谢学旨在全面分析各种代谢物,从非极性脂肪酸到小极性分子.
• 由于其广泛的化学多样性,没有任何一种单一的分析技术可以捕获整个代谢物谱.
• 胃肠道 stromal 瘤 (GIST) 呈现出一个复杂的代谢环境,受遗传突变和药物治疗的影响.

研究的目的:

• 评估不同分析技术的覆盖范围和优势,以对GIST进行非向的代谢学分析.
• 在GIST分析中,比较气体染色体质谱学 (GC-MS) 和液体染色体质谱学 (LC-MS) 与不同的静止相 (逆相和HILIC) 的疗效.
• 在GIST模型中确定最佳的分析方法来检测因伊马替尼布诱导的代谢变化.

主要方法:

• 应用GC-MS和LC-MS与逆相 (RP) 和水友交互液体色谱 (HILIC) 静止相.
• 来自四种不同的突变模型的GIST异种移植样本 (n=71) 的分析,其中一半被治疗了imaatinib.
• 对代谢物检测率的比较评估以及在不同技术中区分突变模型和治疗效果的能力.

主要成果:

• 逆相LC-MS (RP-LC-MS) 检测到代谢物的数量最多,主要是由于GIST中的脂肪成分丰富.
• 所有使用的技术都成功地区分了不同的GIST突变模型.
• RP-LC-MS和GC-MS在识别因伊马替尼布引起的代谢变化方面比HILIC-LC-MS更有效,揭示了更多的显著变化的代谢物.

结论:

• 结合GC-MS和RP-LC-MS,可以全面覆盖GIST代谢组.
• RP-LC-MS和GC-MS足以进行全球GIST代谢基因组分析,并特别适用于检测药物诱导的变化.
• 这些选择的技术提供了一种更有效的方法,与绿色化学原则保持一致,与使用所有三种方法相比,节省了时间和劳动力.