在废水和空气样本中的SARS-CoV-2RNA的量化和全基因组表征
José Gonçalves1, Priscilla Gomes da Silva2, Tom Koritnik3
1Institute of Sustainable Processes, University of Valladolid; Department of Chemical Engineering and Environmental Technology, University of Valladolid; Department of Public Health Microbiology, National Laboratory of Health, Environment and Food; zemcg5@gmail.com.
Journal of visualized experiments : JoVE
|July 17, 2023
概括
基于废水的流行病学为跟踪SARS-CoV-2提供了一种强大的方法. 这项研究适应了这些技术来检测和量化包括SARS-CoV-2在内的病毒,在废水和空气样本中.
科学领域:
- 环境微生物学环境微生物学
- 病毒学 病毒学
- 公共卫生监督是对公共卫生的监督.
背景情况:
- 基于废水的流行病学是一种有效的工具,用于监测像SARS-CoV-2这样的传染病.
- 在空气样本中可以检测和量化SARS-CoV-2病毒,这表明空气传播是重要的传播途径.
- 已建立的协议存在用于分析废水,但适应它们用于空气样本需要改进.
研究的目的:
- 为环境检测,定量和对病毒进行测序提出一种复合方法.
- 调整基于废水的流行病学技术,用于分析空气样本.
- 为传染病原体的全面环境监测提供一个框架.
主要方法:
- 废水度和核酸提取.
- 通过PCR扩展病毒基因组段.
- 从环境样本 (废水和空气) 中检测,定量和测序病毒RNA.
主要成果:
- 证明了将废水分析技术应用于空气样本的可行性.
- 在两种样本类型中检测和量化SARS-CoV-2RNA的建立协议.
- 为检测到的病毒的环境测序提供了基础.
结论:
- 提出的复合协议使SARS-CoV-2和其他病毒的环境监测得以强大.
- 这种方法提高了我们通过环境监测了解和控制传染病传播的能力.
- 污水和空气中的病毒的环境检测和测序对公共卫生至关重要.
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