应用不同的采样方法与元基因组下一代测序相结合,以检测重症肺炎儿童机械通风时的病原体
Xiangzhen Nan1, Jijie Yu1, Yafeng Liang1
1Department of Pediatric Intensive Care Unit, The Second Affiliated Hospital and Yuying Children's Hospital of Wenzhou Medical University, Wenzhou, Zhejiang, People's Republic of China.
Infection and drug resistance
|July 19, 2023
概括
下一代元基因组测序 (mNGS) 改善了重症肺炎儿童的病原体检测. 与mNGS相结合的内抽吸和支气管洗液采样方法都显示出比传统方法更高的诊断效率.
科学领域:
- 儿科重症监护医药 儿科重症监护医药
- 传染病诊断 传染病诊断 传染病诊断
- 基因组技术 基因组技术
背景情况:
- 在需要机械通风的儿童中,严重的肺炎带来了诊断挑战.
- 传统的病原体检测方法往往在灵敏度和速度上有局限性.
- 下一代元基因组测序 (mNGS) 为全面的病原体识别提供了一个有前途的方法.
研究的目的:
- 评估将不同采样方法与mNGS结合用于儿童重症肺炎病原体检测的诊断价值.
- 为了比较基于mNGS的病原体检测的有效性,使用内吸与支气管支气管洗液 (BALF) 取样.
- 评估mNGS的性能与传统的病因检测策略相比.
主要方法:
- 研究了一组40名患有严重肺炎的机械通风的儿童.
- 采集了常规的内吸管和BALF样本用于mNGS分析.
- 将mNGS (采用不同的采样方法) 和传统的病原体检测技术之间的诊断效率进行了比较.
主要成果:
- 与传统的病因学方法相比,mNGS表现出明显更高的病原体检测阳性率 (P < 0.05).
- 在例行内吸 + mNGS和BALF + mNGS (P > 0.05) 之间没有观察到积极检测率的显著差异.
- mNGS被证明比传统的病原体诊断策略更有效.
结论:
- mNGS是一种高效的工具,用于诊断儿科重症肺炎的病原体.
- 当与mNGS相结合时,内吸和BALF采样都是可行的方法.
- 对mNGS采样方法的临床选择应以患者的病情为指导,以改善诊断和治疗.
