鉴定和验证最佳的基因参考标准化基因表达造型诊断面板的PH型B系急性淋巴细胞白血病的最佳基因标准化

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 分子生物学分子生物学
• 生物统计学 生物统计学

背景情况:

• 基因表达概况 (GEP) 对于识别类似Ph的急性淋巴细胞白血病 (ALL) 是至关重要的.
• 使用稳定的家政基因 (HKGs) 准确地规范化目标基因对于GEP的定量PCR (qPCR) 非常重要.
• 不同的HKG表达可能导致不准确的qPCR结果,影响识别高风险的Ph类ALL.

研究的目的:

• 为了评估9个HKG在Ph类ALL和Ph负ALL病例中的表达稳定性.
• 为了确定最稳定的HKGs用于准确的GEP和诊断Ph类ALL.
• 为了验证过度表达的基因在Ph类ALL病例中的表达.

主要方法:

• 九个HKG (GAPDH,ACTB,GUSB,RNA18S,EEF2,PGK1,B2M,TBP,ABL1) 的表达稳定性被评估在Ph类ALL和Ph负ALL (每个n=23) 中.
• 使用了六种算法:geNorm,BestKeeper,NormFinder,Delta Cq方法,RefFinderTM和ComprFinder. 这些算法包括:
• 在Ph类ALL中验证了8个过度表达的基因.

主要成果:

• EEF2,GAPDH和PGK1被确定为Ph类ALL最稳定的HKG.
• 发现RNA18s,β-actin和ABL1在Ph阴性ALL中稳定.
• EEF2,GAPDH和PGK1的组合显示出非常高的相关性,代表了Ph类ALL的最佳HKG集.

结论:

• 建议EEF2,GAPDH和PGK1作为最好的HKG,用于在Ph类ALL中准确的GEP.
• 这些HKG可以被纳入用于Ph类ALL的诊断面板,在基线诊断时使用qPCR.
• 这项研究为改善Ph类ALL的分子诊断提供了基础.