μMap 光近距离标记使小分子结合点的映射成为可能
Sean W Huth1,2, James V Oakley1,2, Ciaran P Seath1,2
1Merck Center for Catalysis at Princeton University, Princeton, New Jersey 08544, United States.
Journal of the American Chemical Society
|July 20, 2023
概括
我们开发了一种新的光催化方法, 这种方法可以识别连接体结合口袋附近的氨基酸,为体外和活细胞中药物发现和向参与分析提供了强大的工具.
科学领域:
- 化学生物学
- 药物发现
- 蛋白质组学
背景情况:
- 在药物发现中,结合位的表征至关重要,尤其是在最初未知位的表型查中.
- 像X射线结晶学和光亲和度标签 (PAL) 这样的现有方法有局限性,包括技术上的挑战,信号差,以及复杂的数据分析.
研究的目的:
- 建立一个强大的和一般的光催化方法来绘制蛋白质结合点,识别靠近连接体结合口袋的残留物.
- 证明这种方法对分析各种蛋白质标和候选药物的有用性,包括那些没有现有的结构数据的蛋白质.
主要方法:
- 开发一种催化光催化方法 (μMap) 用于蛋白质结合部位的映射.
- 使用催化激活来标记靠近配体结合部位的氨基酸.
- 在实验室中对六个蛋白质点和活细胞的应用.
主要成果:
- 成功地绘制了六个不同的蛋白质标的结合部位,包括激酶和分子.
- 研究了STAT3抑制剂MM-206的结合部位,该结合物缺乏晶体结构数据.
- 在活细胞中成功地绘制药物结合部位.
结论:
- μMap提供了一种强大且可通用的方法来识别靠近连接体结合口袋的氨基酸.
- 该技术产生了有价值的氨基酸和水平目标参与数据.
- μMap可以在体外和活细胞中进行结合部位的表征,从而促进药物发现工作.


